蛋白組學(xué)在心血管方面的研究進展解福生-醫(yī)學(xué)論文
蛋白組學(xué)在利用干細胞修復(fù)心臟的概念具有巨大的潛力,但在臨床實驗之前,必須不確定性的治療應(yīng)用處理。蛋白質(zhì)組技術(shù)可以幫助當代表征細胞準備更充分,找出潛在的原因,可能導(dǎo)致臨床試驗失敗率較高一些。我們討論了更廣泛的應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)干細胞提供蛋白質(zhì)的主要技術(shù),并說明他們可能幫助干細胞療法翻譯細胞研究。關(guān)于內(nèi)皮祖細胞(朋)的爭議,其為標志物的分配和細胞純度評估警示標志。內(nèi)皮祖細胞中早期生長蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)導(dǎo)方法已經(jīng)提出了該標記用于確定其潛在的可能引起內(nèi)皮細胞的蛋白質(zhì)攝取血小板的認識。血小板微粒有關(guān)的特性轉(zhuǎn)移到單核內(nèi)皮細胞可以導(dǎo)致該法的誤解。同樣,血小板和血小板微粒的存在是沒有考慮到當功能上的改進是直接歸因于內(nèi)皮祖細胞,而鹽溶液或純介質(zhì)作為對照組。因此,蛋白質(zhì)組學(xué)闡明一個共同的干細胞在心血管研究分析,這或許可以解釋在一些領(lǐng)域的矛盾的新警告燈。
1蛋白質(zhì)組學(xué)在各種蛋白修飾和標記中的應(yīng)用
氨基酸標記策略在蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)中非常普遍@。由于質(zhì)譜是作為蛋白質(zhì)科學(xué)檢測技術(shù)(臨)的關(guān)鍵技術(shù),所以對氨基酸進行標記顯得非常重要。
系統(tǒng)研究往往是旨在發(fā)現(xiàn)的基本原則,支配或疾病背后的分子途徑。為了達到這個目的我們需要不斷進行技術(shù)開發(fā)。在此背景下,技術(shù)是指技能、伩器伩表和用來解決問題的方法乂策略。因此,每一個技術(shù)必須有某種特定的用途和使用。蛋白質(zhì)組學(xué)是一個被驅(qū)動的發(fā)展和技術(shù)的戰(zhàn)略性應(yīng)用,它會繼續(xù)快速的發(fā)展。
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)被用于研究的復(fù)雜性和他們的生物作用的蛋白質(zhì),包括生物物理性質(zhì)、結(jié)構(gòu)和功能。它是基于一個前提,那就是他們的多樣性,包括蛋白質(zhì)的種類、單點核苷酸多型性、翻譯后修飾等有關(guān)生物學(xué)范疇的知識。對于大部份的蛋白質(zhì)來說,翻譯后修飾是蛋白質(zhì)生物合成的較后步驟。蛋白質(zhì),或是多肽,是一條胺基酸的鏈。當合成蛋白質(zhì)時,20種不同的胺基酸會合并成為蛋白質(zhì)。胺基酸的翻譯后修飾會附在蛋白質(zhì)其他的生物化學(xué)官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)改變胺基酸的化學(xué)性質(zhì),或是造成結(jié)構(gòu)的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質(zhì)的功能。再者,酶可以從蛋白質(zhì)的〜末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素是肽的激素,它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質(zhì)包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。其他修飾,就像磷酸化是控制蛋白質(zhì)活動機制的一部份。蛋白質(zhì)活動可以是令酶活性化或鈍化。蛋白質(zhì)發(fā)生變化,是因為生理和病理過程的反射在基因,哪八,舊哪八和代謝水平的變化。因此,由信息從蛋白質(zhì)組蛋白的表達,磷酸化、加工、定位。改變翻譯后修飾的化學(xué)本質(zhì)的一種氨基酸的變化,能夠引發(fā)殘留在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、活力、結(jié)合伙伴或亞細胞定位。翻譯后修飾可以添加或刪除特定的氨基酸殘基,翻譯后修飾包括以下加入官能團的反應(yīng):乙?;煌ǔS诘鞍踪|(zhì)的^末端加入乙酰。烷基化一加入如甲基或乙基等烷基。甲基化一烷基化中常見的一種,在賴氨酸、精氨酸等的側(cè)鏈氨基上加入甲基。生物素化一用生物素附加物令保存的賴氨酸?;?。谷氨酸化一在谷氨酸與導(dǎo)管素及其他蛋白質(zhì)之間建立共價鍵。甘氨酸化一在一個至超過40種甘氨酸與導(dǎo)管素的0末端建立共價鍵。糖化一將糖基加入天冬酰胺、羥離氨酸、絲氨酸或蘇氨酸,形成糖蛋白。異戊二烯化一加入如法呢醇及四異戊二烯等異戊二烯。硫辛酸化一一附著硫辛酸的功能性。磷酸泛酰巰基乙胺基化―像在脂肪酸、聚酮、非核糖體肽鏈及白氨酸的生物合成中,從乙酰輔酶八加入4’磷酸泛酰巰基乙胺基。磷酸化一加入磷酸根至絲氨酸、酪氨酸、蘇氨酸或組氨酸。硫酸化一將硫酸根加入至酪氨酸。硒化0末端酰胺化。蛋曰質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域正在努力的研究和量化蛋白質(zhì)的多樣性。它代表了一大類所產(chǎn)生的技術(shù)和方法分析,比如:蛋白質(zhì)生物化學(xué)、解析分離、質(zhì)譜和生物信息學(xué)。許多技術(shù)是相輔相成的作用^提供不同的數(shù)據(jù)為每個蛋白質(zhì)組。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展也可以被應(yīng)用到特定的生物學(xué)和臨床問題上,這是互相起作用的過程,因為應(yīng)用不同的技術(shù)可以提供額外的視角和產(chǎn)生新的假設(shè),有時能夠協(xié)助方法論的提煉和優(yōu)化甚至產(chǎn)生大量的新技木。
技術(shù)的發(fā)展是--個涉及多個步驟的過程,這些步驟是:①開發(fā)階段,新的方法或技術(shù)在嘗試和錯誤中產(chǎn)生;②樣機制作,其一致性和變異性是確定的;③早期大規(guī)模生產(chǎn),其方法只需要很少的變化,是在多個不同的環(huán)境和條件下測試,并在條件允許的情況下進行微調(diào);④正常生產(chǎn)和標準化,技術(shù)已經(jīng)非常成熟并極少有問題產(chǎn)生;⑤建立方法,在更廣泛的科學(xué)界建立強大的技術(shù);⑥技術(shù)過時,此方法已經(jīng)不被需要或者被更好的技術(shù)所取代。和許多其他的組織相比,蛋白質(zhì)組學(xué)分析的心肌細胞和組織是一項特別的挑戰(zhàn),造成這種現(xiàn)象的原因是多因素的。比如:沒有劃分為心室心肌細胞的細胞培養(yǎng)系統(tǒng)。蛋白組學(xué)的主要技術(shù)
為了利用蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),我們必須找到辦法來整合數(shù)據(jù)和模型的發(fā)展,了解細胞和器官的復(fù)雜性㈤。此外,我們需要更好的方法來改變蛋白質(zhì)之間的聯(lián)系和直接的功能和環(huán)境的健康和疾病細胞定位。令人興奮的是,技術(shù)不是靜止的,它將繼續(xù)對舊技術(shù)進行改進和開發(fā)改造新的方法。蛋白質(zhì)組學(xué)在心血管領(lǐng)域的研究正在迅速演變,更多新的發(fā)現(xiàn)貨出現(xiàn),科學(xué)界也會更多的采用蛋白質(zhì)組學(xué)方法。
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